MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Edwardsiella tarda FL6-60 plasmid pFL6-60

Total Repeats: 126

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017318	CTG	2	6	32	37	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_017318	CAGC	2	8	48	55	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3	NC_017318	TGGCC	2	10	73	82	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
4	NC_017318	TGGT	2	8	108	115	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017318	ATC	2	6	122	127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_017318	ATG	3	9	143	151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017318	CGG	2	6	175	180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_017318	GCT	2	6	289	294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_017318	GCG	2	6	315	320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_017318	GT	3	6	325	330	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017318	CGG	2	6	486	491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_017318	CGG	2	6	495	500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_017318	AGC	2	6	543	548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_017318	GCT	2	6	664	669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_017318	TGC	2	6	781	786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_017318	GAA	2	6	809	814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017318	GGTC	2	8	919	926	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
18	NC_017318	CTG	2	6	965	970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_017318	GGA	2	6	1003	1008	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017318	GAA	2	6	1036	1041	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017318	ACC	2	6	1139	1144	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_017318	CGA	2	6	1158	1163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_017318	ATC	2	6	1211	1216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_017318	ACG	2	6	1218	1223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_017318	GCC	2	6	1265	1270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_017318	CGA	2	6	1275	1280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_017318	GCC	2	6	1382	1387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_017318	AAG	2	6	1437	1442	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017318	TCCG	2	8	1461	1468	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
30	NC_017318	TTA	2	6	1515	1520	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017318	TTA	2	6	1560	1565	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017318	TGC	2	6	1612	1617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_017318	GGC	2	6	1639	1644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_017318	GAC	2	6	1738	1743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_017318	GCT	2	6	1797	1802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_017318	G	8	8	2479	2486	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017318	GCA	2	6	4258	4263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_017318	T	6	6	4282	4287	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017318	GAG	2	6	8174	8179	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017318	GTA	2	6	8891	8896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017318	ATT	2	6	9325	9330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017318	ATAA	2	8	9337	9344	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017318	A	6	6	9343	9348	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017318	TCC	2	6	14843	14848	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_017318	CTA	2	6	14856	14861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_017318	GTG	2	6	15579	15584	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017318	TGT	2	6	15647	15652	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017318	TC	3	6	15655	15660	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_017318	TTAA	2	8	15696	15703	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017318	TGAGA	2	10	15723	15732	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017318	CCA	2	6	16633	16638	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_017318	TGGGG	2	10	19415	19424	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017318	T	7	7	19468	19474	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017318	ATC	2	6	19541	19546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_017318	ATG	2	6	19548	19553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017318	A	6	6	19574	19579	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017318	ATG	2	6	19589	19594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017318	GGC	2	6	19634	19639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_017318	ATGC	2	8	19707	19714	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
60	NC_017318	AATC	2	8	19770	19777	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_017318	TAAA	2	8	19789	19796	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017318	GAA	2	6	19808	19813	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017318	ACC	2	6	19886	19891	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_017318	CAT	2	6	19957	19962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_017318	T	6	6	19971	19976	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017318	GT	3	6	19987	19992	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017318	ATG	2	6	20002	20007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017318	AC	3	6	20033	20038	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_017318	GTT	2	6	21572	21577	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017318	GT	3	6	21586	21591	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017318	ACG	2	6	24417	24422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_017318	TTAT	2	8	26720	26727	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017318	CA	3	6	26731	26736	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_017318	T	6	6	26737	26742	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017318	CA	3	6	26803	26808	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_017318	TG	4	8	26883	26890	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017318	G	6	6	26920	26925	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017318	A	6	6	26972	26977	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017318	TGAT	2	8	27014	27021	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017318	ATT	2	6	27022	27027	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017318	TTA	2	6	27028	27033	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017318	AAT	2	6	27876	27881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017318	TTA	2	6	27882	27887	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017318	GTA	2	6	27946	27951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017318	GTAG	2	8	28010	28017	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017318	CTG	2	6	28124	28129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_017318	TG	3	6	28245	28250	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017318	TTG	2	6	28974	28979	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017318	GAA	2	6	29007	29012	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017318	ACC	2	6	29222	29227	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_017318	TGA	2	6	29254	29259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017318	CACC	2	8	29291	29298	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
93	NC_017318	AGA	2	6	29306	29311	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017318	C	6	6	31893	31898	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
95	NC_017318	GC	3	6	31926	31931	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
96	NC_017318	T	7	7	32348	32354	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017318	TGTA	2	8	32363	32370	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017318	GCC	2	6	32390	32395	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_017318	GGC	2	6	32411	32416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_017318	TG	3	6	34168	34173	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017318	GTTTG	2	10	35010	35019	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017318	GCC	2	6	35321	35326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_017318	GC	3	6	35444	35449	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
104	NC_017318	CA	3	6	36789	36794	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_017318	ATG	2	6	37738	37743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017318	GAA	2	6	37745	37750	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017318	TCA	2	6	37762	37767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_017318	ACA	2	6	38677	38682	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_017318	G	6	6	38693	38698	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017318	T	6	6	38721	38726	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017318	GGA	2	6	38776	38781	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017318	TAAT	2	8	39008	39015	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017318	GCG	2	6	39024	39029	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_017318	T	6	6	39032	39037	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017318	TTA	2	6	39042	39047	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017318	GCC	2	6	39079	39084	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
117	NC_017318	GCC	2	6	39284	39289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
118	NC_017318	GTGG	2	8	39338	39345	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017318	GGT	2	6	39372	39377	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017318	GAA	2	6	39409	39414	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017318	CAA	2	6	39429	39434	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_017318	GGT	2	6	39659	39664	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017318	GGA	2	6	44063	44068	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017318	CGG	2	6	44071	44076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_017318	GAA	2	6	44091	44096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017318	GAG	2	6	44133	44138	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.